Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc85aQ5SP85 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85aQ5SP85 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms