Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm27Q5SFM8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rbm27Q5SFM8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm27Q5SFM8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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