Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brsk1Q5RJI5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Brsk1Q5RJI5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brsk1Q5RJI5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms