Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trav3-1Q5R1I8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms