Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms