Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm12253Q5NC48 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12253Q5NC48 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms