Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Odf3bQ5M8M2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Odf3bQ5M8M2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms