Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a8Q5HZH7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Slc38a8Q5HZH7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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