Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkaa1Q5EG47 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms