Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms