Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chsy3Q5DTK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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