Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf354cQ571J5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf354cQ571J5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms