Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GpkowQ56A08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GpkowQ56A08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms