Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpjQ569L8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms