Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spire1Q52KF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms