Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnl1Q52KE7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms