Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otol1Q4ZJM7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms