Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms