Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3lQ4KL14 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms