Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shank3Q4ACU6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shank3Q4ACU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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