Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
6430531B16RikQ3V2J1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430531B16RikQ3V2J1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms