Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ckap2Q3V1H1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2Q3V1H1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms