Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp48Q3V0C5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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