Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pate2Q3UW31 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pate2Q3UW31 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms