Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clpsl2Q3UW21 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms