Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fchsd2Q3USJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms