Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vwa5b2Q3UR50 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms