Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms