Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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