Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms