Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms