Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cobll1Q3UMF0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms