Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms