Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ell2Q3UKU1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ell2Q3UKU1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms