Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcgf5Q3UK78 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcgf5Q3UK78 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms