Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms