Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q3UJC8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3UJC8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms