Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms