Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod2Q3UHZ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lmod2Q3UHZ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod2Q3UHZ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms