Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mier3Q3UHF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mier3Q3UHF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms