Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms