Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5113Q3UGK8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms