Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms