Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trip13Q3UA06 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip13Q3UA06 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms