Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U6N9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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