Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gse1Q3U3C9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms