Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm4dQ3U2K5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Kdm4dQ3U2K5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms