Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam193bQ3U2K0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam193bQ3U2K0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms