Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd33bQ3U0L2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms