Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd6Q3TY92 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms